Novinky v daních

Rok 2026 přináší jednu z největších vln změn posledních let. Nejde jen o jednotlivé novely, ale o systémový posun – v daňové oblasti, účetnictví i v administrativě zaměstnavatelů. Některé změny už platí, jiné se teprve chystají, ale většina z nich vyžaduje včasnou přípravu. Shrnujeme ty nejdůležitější novinky a jejich praktické dopady. 

1. Zaměstnanci, mzdy a benefity: konec „optimalizací“ a více administrativy 

Zaměstnanecké benefity: jasná hranice mezi benefitem a mzdou 

Novela zákona reaguje na judikaturu Nejvyššího správního soudu a výslovně zpřesňuje pravidla pro osvobození „volnočasových“ benefitů. Cílem je zabránit praxi, kdy část mzdy byla fakticky maskována jako benefit. 

Nově platí, že daňově osvobozené mohou být pouze plnění nad rámec mzdy, nesmí souviset s konkrétním výkonem práce. 

Typicky se jedná o: 

  • Multisport karty 

  • příspěvky na zdraví, sport, kulturu nebo rekreaci 

Naopak, jakékoli plnění navázané na pracovní výkon je považováno za mzdu – bez ohledu na formu, a i když je poskytnuto na vyjmenované účely, nelze související příjem osvobodit. 

Dohody a srážková daň: změny pokračují 

Limity pro dohody o provedení práce a zaměstnání malého rozsahu se každoročně mění. Zásadní je ale výhled do roku 2027, kdy má dojít ke zrušení srážkové daně u podlimitních dohod. Zároveň se však zavádí úpravy v povinnosti podání daňového přiznání pro zaměstnance či OSVČ, které používají paušální daň tak, aby tyto drobné přivýdělky ani po změně nepřinášely vyšší administrativní zátěž ve formě povinnosti podání přiznání.  

Jednotné měsíční hlášení zaměstnavatele (JMHZ): zásadní zlom 

Od 1. dubna 2026 startuje jednotné měsíční hlášení zaměstnavatele. Jde o digitalizační projekt, který má nahradit opakované zasílání stejných údajů různým úřadům. 

Hlavní rysy: 

  • povinnost se týká všech zaměstnavatelů 

  • údaje se budou hlásit individualizovaně za každého zaměstnance a pracovní úvazek 

  • podání výhradně elektronicky do 20. dne následujícího měsíce 

Ačkoliv má JMHZ administrativu zjednodušit, minimálně na počátku projektu bude znamenat výraznou zátěž, zejména nutnost úprav mzdových systémů a interních procesů. 

2. Fyzické osoby: kryptoměny, akcie a OSVČ 

Konec limitu 40 milionů u prodeje cenných papírů a podílů 

Jednou z nejvýraznějších změn je zrušení limitu 40 milionů Kč pro osvobození příjmů z prodeje cenných papírů a obchodních podílů u fyzických osob – při splnění časového testu (3 roky u cenných papírů, 5 let u podílů). 

Změna je platná od 1. ledna 2026 a má zásadní praktický dopad: 

  • Osvobozené příjmy podléhají limitu pouze, pokud byly realizované v roce 2025 

  • Příjmy obdržené od 1. 1. 2026 jsou při splnění časového testu zcela osvobozené, bez horního stropu 

Příklad: 
Fyzická osoba prodá v roce 2025 podíl ve firmě za prodejní cenu 60 mil. Kč. Pokud prostředky z prodeje podílu obdrží ještě v roce 2025, část příjmu nad 40 mil. Kč podléhá zdanění. Pokud by stejný příjem obdržela až v lednu 2026, byl by celý osvobozen. 

Limit 40 mil. Kč zůstane od roku 2026 zachován pouze u úplatného převodu kryptoaktiv. 

Zaměstnanecké akcie a opce: nový režim pro startupy 

Zdanění zaměstnaneckých akciových a opčních programů prošlo v posledních letech sérií změn. Od dubna 2025 se systém stabilizuje: 

  • okamžik zdanění volí zaměstnavatel 

  • lze zdanit ihned, nebo zvolit odložení až o 10 či 15 let 

  • nově vzniká zvláštní režim kvalifikovaných opcí (zejména pro startupy), kde příjem nebude podléhat pojistnému 

Klíčové je splnění oznamovací povinnosti a správné nastavení opčního programu.  

Nízkoemisní vozidla: jednodušší definice, větší jistota 

Od roku 2026 se mění definice nízkoemisního vozidla pro účely daně z příjmů. Dobrou zprávou je, že: 

  • odpadá vazba na evropské emisní směrnice 

  • rozhodující je pouze emise CO₂ do 50 g/km a kategorie vozidla (M1, M2, N1) 

Zůstává tak zachováno zvýhodnění v podobě 0,5 % měsíčně z pořizovací ceny při užívání služebního vozu i pro soukromé účely. 

OSVČ: rostoucí minimální odvody 

U OSVČ pokračuje růst minimálního vyměřovacího základu pro sociální pojištění. V roce 2026 dosahuje minimální měsíční záloha 5 720 Kč (u hlavní činnosti). Zdravotní pojištění se zvyšuje pouze vlivem růstu průměrné mzdy, v roce 2026 na 3 306 Kč. 

3. Daň z příjmů právnických osob: investice, výzkum a energie 

Výzkum a vývoj: výrazně vyšší daňová podpora 

Novela umožňuje uplatnit: 

  • 150 % nákladů na VaV až do 50 mil. Kč (za jedno zdaňovací období) 

  • 100 % nákladů nad tento limit 

Zároveň se prodlužuje doba pro uplatnění odpočtu až na 5 let. U skupin se limit 50 mil. Kč posuzuje společně, což brání umělému dělení projektů. Pro firmy investující do vývoje jde o jednu z nejvýznamnějších prorůstových změn posledních let. 

Konec speciálních odpisů FVE: návrat k obecným pravidlům 

Od 1. srpna 2025 je zrušen speciální 20leté odpisy fotovoltaických elektráren. Nově se FVE odpisují podle obecné úpravy: 

  • stavební část obvykle ve 4.–6. odpisové skupině 

  • technologická část (panely, střídače) samostatně, zpravidla ve 2. nebo 3. skupině 

  • bateriová úložiště ve 2. skupině 

V případě, že bylo zahájeno odpisování v období 1.7.2024 - 31.7.2025, se mohl poplatník rozhodnout, zda využije nový režim, nebo bude pokračovat v časových odpisech.  

Navýšení limitu pro tvorbu opravné položky u malých pohledávek (§ 8c) 

Od 1. ledna 2026 se zvyšuje limit pro „malé“ pohledávky, ke kterým lze jednorázově vytvořit 100% daňovou opravnou položku, a to z 30 000 Kč na 50 000 Kč. Změna platí bez přechodného ustanovení. Finanční správa prostřednictvím Koordinačního výboru Komory daňových poradců potvrdila, že zvýšený limit se uplatní na všechny pohledávky splňující podmínky uvedeného ustanovení, bez ohledu na okamžik jejich vzniku či splatnosti – tedy i na ty, které vznikly nebo se staly splatné do 31. 12. 2025. 

Dorovnávací daň: více času na přípravu podání 

U skupin s obratem nad 750 mil. EUR se prodlužují lhůty pro podání přiznání k dorovnávací dani až na 22 měsíců po konci období. Česká úprava se tím přibližuje modelovým pravidlům OECD. 

4. Daň z přidané hodnoty: významné změny nejen u nemovitostí, vyšší odpovědnost a nové procesy 

Oblast DPH prochází v letech 2025–2026 postupnou, ale velmi citelnou proměnou. Změny se netýkají sazeb jako takových, ale především procesů, lhůt a odpovědnosti plátců. V praxi to znamená vyšší nároky na evidenci, kontrolu dodavatelů a práci s doklady. 

Nový mechanismus vrácení nesprávně odvedené DPH  

  • Od roku 2026 se zavádí nový postup pro případy, kdy byla DPH odvedena nesprávně, typicky: 

    • měl být použit režim přenesení daňové povinnosti, ale nebyl; 
    • byla uplatněna chybná sazba; 
    • bylo nesprávně určeno místo plnění. 

  • Pokud dodavatel DPH státu odvedl, ale nevrátil ji odběrateli (např. z důvodu insolvence), vzniká za splnění zákonných podmínek možnost, aby se odběratel domáhal vrácení daně přímo vůči správci daně. 

  • Tento mechanismus má zabránit situacím, kdy by DPH byla fakticky zaplacena dvakrát, zároveň je ale procesně i důkazně velmi náročný a bude využitelný spíše ve výjimečných případech. 

Změna u korekce odpočtu DPH u dlouhodobého majetku pro smíšené účely 

  • V posledním přiznání k DPH kalendářního roku se musí korigovat nebo potvrdit odpočet DPH uplatněný u dlouhodobého majetku (např. automobilu), který se používá jak pro ekonomické, tak neekonomické (zejm. soukromé) účely. 

  • Nově, tj. již pro rok 2025, se tato korekce musí provést v prvním roce, i když změna mezi koeficientem dle kvalifikovaného odhadu při pořízení dlouhodobého majetku a výsledným ročním koeficientem činí jen 1 procentní bod. 

  • V dalších čtyřech (u nemovitostí devíti) letech zůstává pravidlo, že se uplatněný odpočet DPH může nebo musí upravit pouze v případě, že rozdíl vůči koeficientu prvního roku přesáhne 10 procentních bodů. 

Další finanční činnosti nelze osvobodit od DPH 

  • Ve 2025 skončila možnost osvobozovat  

    • obhospodařování majetku zákazníka na základě smlouvy se zákazníkem, pokud je součástí majetku investiční nástroj. 

  • Ve 2026 již nelze uplatňovat osvobození u  

    • obstarávání inkasa; 
    • vedení evidence investičních nástrojů; 
    • vybírání poplatků za rozhlasové a televizní vysílání; 
    • výplaty dávek důchodového pojištění a vybírání opakovaných plateb obyvatelstva. 

Plátcovství k DPH: nové počítání obratu a okamžik vzniku povinnosti 

  • Od roku 2025 se obrat pro účely DPH posuzuje za kalendářní rok, nikoliv klouzavě za 12 měsíců. Zároveň se mění okamžik vzniku plátcovství: 

    • při překročení základního limitu (2 mil. Kč) vzniká plátcovství zpravidla až od 1. ledna následujícího roku, 
    • při překročení vyšší hranice, konkrétně 2 536 500 Kč, vzniká plátcovství bezprostředně, již dnem následujícím po dni překročení limitu. 

  • Pro rok 2026 to znamená nutnost průběžně sledovat obrat v rámci kalendářního roku, jinak hrozí pozdní registrace a následné doměrky. 

Oprava odpočtu při nezaplacení závazku 

  • Od roku 2025 vzniká nový důvod pro opravu (vrácení) uplatněného odpočtu DPH v běžném režimu. Pokud příjemce plnění nezaplatí závazek ze zdanitelného plnění do konce šestého kalendářního měsíce po měsíci splatnosti, vzniká povinnost tuto skutečnost zohlednit v DPH. 

  • V praxi to zvyšuje význam práce s otevřenými závazky a jejich pravidelného sledování. 

Ručení za DPH: důraz na „věděl nebo měl vědět“ 

  • Zpřísňuje se koncepce ručení příjemce plnění za neodvedenou DPH dodavatelem. Klíčovým se stává test, zda příjemce: 

    • věděl, nebo vědět měl a mohl, že daň nebude úmyslně uhrazena. 

  • Správce daně bude posuzovat okolnosti obchodu, cenu, platební podmínky i chování smluvních stran. V roce 2026 tak ještě více vzroste význam prověřování dodavatelů, interní dokumentace a obhajitelnosti obchodních rozhodnutí. 

DPH a nemovitosti: režimy, sazby a volba zdanění 

  • V polovině roku 2025 došlo k přelomové změně u dodaní nemovitých věcí, které mají přímý dopad především na developery, investory i pronajímatele nemovitostí. 

  • Povinnému zdanění podléhá již jen první dodání dokončené nemovité věci v rámci dvouleté lhůty. Další dodání v rámci této lhůty anebo dodání po uplynutí lhůty je osvobozeno od daně bez nároku na odpočet. Možnost dobrovolného zdanění dodání nemovitostí, které by jinak byly osvobozeny od DPH, zůstává zachována. 

  • Další významnou změnou je nové posuzovávání podstatné změny nemovité věci (zejména rekonstrukce). Od této změny běží znova dvouletá lhůta, ve které se považuje opět první dodání zrekonstruované nemovitosti za zdanitelné plnění. Podstatná změna zjednodušeně nastane v případě, že hodnota rekonstrukce přesáhne 30 % prodejní ceny bez DPH. 

  • Definice stavebního pozemku se dočkala upřesnění přímo v zákoně. Kromě jiného je stěžejní (ne)zanesení pozemku do územně-plánovací dokumentace obce. 

  • Upravují se také pravidla pro uplatnění snížené sazby DPH u staveb pro bydlení a sociální bydlení a zpřesňuje se práce s podlahovými plochami.  

  • Zároveň se rozšiřují možnosti dobrovolného zdanění u vybraných dodání a nájmů nemovitostí ve vztahu k zahraničním subjektům. 

Nárok na odpočet: zkrácení lhůt 

  • Jednou z nejcitelnějších změn je zkrácení lhůty pro uplatnění nároku na odpočet. Nově lze odpočet uplatnit pouze do: 

    • dvou kalendářních let bezprostředně následujících po roce, ve kterém nárok vznikl. 

  • Tato změna zvyšuje riziko „propadnutí“ odpočtů u starších dokladů a klade vyšší nároky na: 

    • včasné zaúčtování, 
    • kontrolu přijatých plnění, 
    • řešení chyb ještě v kratších lhůtách. 

Odpočet při registraci k DPH: širší možnosti u dlouhodobého majetku 

  • Pozitivní změnou je rozšíření možnosti uplatnit odpočet DPH při registraci, a to zejména u dlouhodobého majetku. Za splnění zákonných podmínek lze nově uplatnit odpočet i z plnění přijatých až pět let zpětně, pokud byl majetek uveden do užívání až po vzniku plátcovství. 

Výhled do dalších let: DPH v digitálním věku (ViDA) 

  • Ačkoli hlavní účinnost evropského projektu DPH v digitálním věku (ViDA) nastane až po roce 2028, následující roky jsou klíčové z pohledu příprav. ViDA přinese: 

    • povinné digitální reportování přeshraničních B2B transakcí, 
    • zásadní změnu práce s fakturami a daty, 
    • postupný přechod k e-fakturaci ve strukturovaných formátech. 

  • Firmy, které začnou řešit kvalitu dat a IT připravenost včas, si výrazně usnadní budoucí přechod. 

5. Účetnictví: nové limity a nové povinnosti 

Nové kategorie účetních jednotek 

Zvyšují se limity pro kategorizaci účetních jednotek. Pro účely stanovení kategorie účetní jednotky pro rok 2026 se hodnoty za roky 2024 a 2025 posuzují již podle nových prahových ukazatelů. Změna kategorie má přímý dopad na: 

  • rozsah účetní závěrky, 

  • povinnost sestavovat cash flow, 

  • povinný audit (nově jen střední a velké jednotky). 

Zpráva o daních z příjmů (Public CbCR) 

Vybrané velké společnosti musí nově zveřejňovat Zprávu o daních z příjmů, která musí být veřejně dostupná po dobu 5 let. Nesplnění povinnosti může vést k pokutě až 3 % hodnoty aktiv. 

6. Daňový řád a kontroly: silnější finanční správa 

Rozsáhlá novela daňového řádu od 1. 7. 2025 a 1. 1. 2026 – zaměřuje se hlavně na vymáhání a úročení, ale přináší i řadu dalších změn: 

  • Konec „úroku z úroku“ (§ 251c DŘ) – nově výslovně vyloučen, přesto zůstává možnost domoci se nápravy u starších případů. 

  • Prominutí až 100 % penále (§ 259a DŘ) – v návaznosti na to Finanční správa vydala nový pokyn GFŘ-D-72, který obsahuje rozšířené možnosti prominutí příslušenství daně. 

  • Nové exekuční nástroje – možnost exekuce movitých věcí z registrů (auta, lodě, letadla), prodej majetkových práv v dražbě (§ 193a), exekuce kryptoaktiv (§ 215a) a zřízení chráněného účtu. 

  • Další změny – úprava pokut za opožděné tvrzení (§ 250), doručování do zahraničí, daňová povinnost při zániku svěřenského fondu (§ 240e).